Viele Leute glauben, dass beim Wasserpfeife rauchen die Giftstoffe durch das Wasser herausgefiltert werden. Dies stimmt nicht. Auch nach dem Wasserbad enthält der Tabakrauch Schadstoffe in hohen Konzentrationen. Die Vorstellung von der Filterfunktion ist reines Wunschdenken. Das Wasserbad kühlt den Tabakrauch lediglich ab. Dadurch kratzt er weniger und man muss weniger husten. Aber gerade das ist „kontraproduktiv“. Der Einstieg ins Rauchen wird dadurch nämlich erleichtert.

Eine Zigarette ist schnell geraucht. Um eine Wasserpfeife zu rauchen, benötigt man hingegen ungefähr 45 Minuten. In dieser Zeit wird mindestens hundertmal mehr Tabakrauch eingeatmet als bei einer einzelnen Zigarette. Entsprechend gelangt auch viel Nikotin in die Lunge. Deshalb kann Shisha rauchen zur Nikotinsucht führen.

Wird beim Wasserpfeiferauchen der Schlauch mit dem gleichen Mundstück in der Runde weitergereicht, können aufgrund von Speichelresten auch Erreger von Krankheiten übertragen werden. Z.B: Hepatitisviren, Tuberkulosebakterien oder Viren für das Lippenherpes. Die können schmerzhafte Bläschen an Lippen und Zunge auslösen.